ΜΟΝΗ ΚΑΘΑΡΩΝ
Η Μονή Καθαρών βρίσκεται κοντά στο ομώνυμο χωριό. Η Παναγία η Καθαριώτισσα είναι η προστάτιδα του νησιού. Η τοπική παράδοση αφηγείται δυο διαφορετικές εκδοχές που αφορούν την ίδρυση της μονής. Σύμφωνα με την πρώτη εκδοχή κάποιοι καλλιεργητές πήγαν στην περιοχή για να κάψουν άγρια χόρτα. Ανάμεσα στα αγριόχορτα βρήκαν την εικόνα της Παναγίας. Έτσι αποφάσισαν να κτίσουν εκεί μία εκκλησία. Ενώ η δεύτερη εκδοχή συνδέει την ίδρυση του μοναστηριού με τους οπαδούς της Καθολικής αίρεσης των Καθαρών.

Πάντως, γεγονός είναι ότι η εκκλησία της Παναγίας κτίστηκε το 1696 και το μοναστήρι, λίγο καιρό αργότερα. H εκκλησία διαθέτει ένα υπέροχο τέμπλο, ενώ από το κωδωνοστάσιο της μονής φαίνεται και το λιμάνι της Ιθάκης.

ΕΚΚΛΗΣΙΑ ΤΗΣ ΑΝΩΓΗΣ
Η εκκλησία της Ανωγής είναι αφιερωμένη στην Κοίμηση της Θεοτόκου και ιδρύθηκε τον 12ο αιώνα. Είναι μια από τις σημαντικότερες εκκλησίες των Βαλκανίων. Είναι βασιλικού ρυθμού και το εσωτερικό το ναού καλύπτεται από βυζαντινές τοιχογραφίες. Ο ναός έχει χαρακτηριστεί διατηρητέο ιστορικό μνημείο.
Τα πολλαπλά στρώματα αγιογραφιών μαρτυρούν ότι η εκκλησία γκρεμίστηκε και ξαναχτίστηκε σε κάποια χρονική περίοδο. Δίπλα στον ναό, υψώνεται επιβλητικό το βενετσιάνικης τεχνοτροπίας καμπαναριό που χτίστηκε το 1682.

ΙΕΡΟΣ ΝΑΟΣ ΠΑΝΑΓΙΑΣ
Ο Ιερός Ναός, της Παναγίας στα Λινοβρόχια, όπως λέγεται η Μητρόπολη της Ιθάκης, κτίστηκε το 1800. Προϋπήρχε ένας μικρός ναός τον οποίο επέκτειναν για τις ανάγκες των ενοριτών. Ξεχωρίζει το ξύλινο τέμπλο του το οποίο είναι μεταβυζαντινής τέχνης του 1793. Κατασκευάστηκε από τον Μετσοβίτη τεχνίτη Ιωάννη Πασχουλίτη.
Παραπλεύρως του Ναού, υπάρχει το περίφημο καμπαναριό με την θαυμάσια πέτρινη δομή του. Η κατασκευή του άρχισε το 1820 και περατώθηκε στις αρχές του 20ου αιώνα.